Принцип работы крионасоса состоит в такой последовательности действий – гелевый компрессор отключается сразу как только закроется затвор. После этого открывается клапан продува, нагревочный газовый элемент и крионасосная рубашка. Температура крионасоса стабилизируется до температуры окружающей среды, т.к. при другой работа насоса не будет правильной.
После этого через клапан выходят газы, которые собраны в насосе, через клапан, находищийся в верхней части насоса. После истечения выбранного промежутка времени, при помощи котроллера отключаются нагреватель газа и продувочный элемент. Работа насоса начинается после того, как откроется форвакуумный клапан.
Затем происходит  один из самых важных этапов – при достижении определенного давления, происходит процесс закрытия форвакуумного клапана и начинается тестирование уровня давления. Этот тест также определяет, есть ли какие либо сбои во всей системе и если они будут выявлены, то на этом этапе их легко исправить.
После окончания теста, запускается гелиевый процессор, благодаря которому  запускается полноценную деятельность всей системы. Большее количество вакуумных насосов функционирует по менее затратному и более простому принципу работы. Но криогенные насосы доказывают то, что они гораздо более производительны, по сравнению с другим вакуумным оборудованием.
Особенно широко криоконденсационную очистку применяют в следующих сферах:
·        При изгтовлении оборудования;
·        В химической промышленности;
·        В металлургии.